Méthodologie des données COVID-19
Cette page rassemble les informations méthodologiques nécessaires à la compréhension des données de COVID-19 publiées sur le site web de l’INSPQ.
Acronymes
- CH : Centre hospitalier
- CHSLD : Centre d'hébergement de soins de longue durée
- CIQ : Comité sur l’immunisation du Québec
- COVID-19 : Le terme COVID-19 (pour Coronavirus Disease 2019) désigne l’infection causée par le virus SRAS-CoV-2
- CV : Couverture vaccinale
- GESTRED : Système de suivi de gestion et de reddition de comptes
- MED-ÉCHO : Maintenance et exploitation des données pour l’étude de la clientèle hospitalière
- MELCCFP : ministère de l’Environnement et de la Lutte contre les changements climatiques, de la Faune et des Parcs
- MSSS : Ministère de la Santé et des Services sociaux (Québec)
- RAMQ : Régie de l'assurance-maladie du Québec
- RI : Ressource intermédiaire
- RLS : Réseau local de service
- RPA : Résidence privée pour aînés
- RSS : Région sociosanitaire
- RVQ : Registre de vaccination du Québec
- SISMACQ : Système intégré de surveillance des maladies chroniques du Québec
- SI-PMI : Système d’information pour la protection en maladies infectieuses
- SI-SPIN : Système d'information pour la surveillance provinciale des infections nosocomiales
- SRAS-CoV-2 : Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) issu du 2e coronavirus, le premier ayant eu lieu en 2002-2004
- TAAN : Test d’amplification des acides nucléiques (PCR en anglais)
- TDAR : Test de détection antigénique rapide
- TSP : Trajectoire de santé publique
- VP : Variants préoccupants
Dates
La page Données COVID-19 au Québec présente les données selon différents types de dates.
Puisqu’il existe un délai entre l’évènement et l’enregistrement de celui-ci dans le système d’information, les données d’évolution présentées par dates réelles d’évènements sont toujours sous-estimées dans les journées les plus récentes, en particulier pour les décès et les hospitalisations. En raison du délai dans la saisie de l’information et d’évènements ayant une date manquante dans le système, le nombre cumulatif d’évènements selon la date réelle est toujours inférieur au nombre cumulatif selon la date rapportée.
Tous les ajustements aux données, comme par exemple le retrait de doublons, les modifications de milieux de vie ou les corrections de l’âge d’une personne décédée, sont faits de façon rétroactive sur les données par dates réelles d’évènements. Ainsi, les ajustements apportés dans le système d’information, comme un rattrapage dans la saisie de données de décès, auront peu d’impact sur la courbe épidémique puisque les cas affectés s’étalent généralement sur une certaine période de temps.
Date de résultat du test
Date à laquelle le résultat du test d’amplification des acides nucléiques (TAAN) est enregistré dans le système d’information du laboratoire.
Date de décès
Date inscrite au certificat de décès, qui correspond au moment où le décès a été constaté par un médecin.
Date d’admission
Date d’admission à l’hôpital.
Décès
Un décès COVID-19 est considéré lorsque la cause initiale du décès est : COVID-19, virus identifié (U07.1) ou COVID-19, virus non identifié (U07.2) selon la 10e édition de la Classification des maladies (CIM-10). Les délais de réception des bulletins de décès peuvent varier selon la région, le groupe d'âge et le mois de l'année.
Les patients atteints de la COVID-19 qui meurent de façon violente (accident, suicide, homicide) ne sont pas comptabilisés dans le bilan officiel de décès.
À propos des graphiques :
- Date de décès : Le nombre de décès par date de décès est une donnée révisée hebdomadairement et rétroactivement. Un délai normal de codification des causes de décès peut être à la source d'une sous-estimation de ces données (représentée par une zone grisée), particulièrement pour les journées les plus récentes.
- Les données sont provisoires pour l'année en cours et doivent être interprétées avec prudence.
- Les décès ayant eu lieu le dimanche, lundi et mardi précédent la mise en ligne du mercredi ne pas disponibles.
- Les graphiques de répartition des décès par âge et sexe n’incluent pas les décès d’âge ou de sexe inconnu. Les totaux pourraient différer des données officielles qui incluent ces données manquantes.
Données régionales
Des données régionales sur la COVID-19 sur les tests, les hospitalisations et les décès, et sont disponibles à la page principale « Données COVID-19 au Québec » via le menu déroulant.
Régions sociosanitaires (RSS)
Sur la page principale, il est possible de sélectionner une région sociosanitaire dans le menu du haut de la page. Une fois la sélection faite, ce sont les données de cette région qui apparaissent dans tous les graphiques de la page.
Les données sur les tests, les hospitalisations et les décès des régions du Nunavik et des Terres-Cries-de-la-Baie-James ainsi que les données sur les hospitalisations de la région Nord-du-Québec ne sont pas présentées.
Hospitalisations
Hospitalisations de patients ayant un test positif de COVID-19
Deux mesures sont présentées concernant ces hospitalisations : les hospitalisations en cours et les nouvelles hospitalisations. Ces mesures décrivent toutes les hospitalisations (i.e. sans égard au diagnostic) de patients ayant un test de laboratoire TAAN positif au SRAS-CoV-2 entre 11 jours avant l’admission et la sortie de l’hôpital. Ces patients doivent avoir séjourné au moins une nuit dans un centre hospitalier de soins généraux et spécialisés offrant des soins aigus. Le nombre d’hospitalisations de patients positifs pourrait être sous-estimé étant donné que le jumelage entre les données d’hospitalisation et les données de laboratoire n’est pas toujours possible (environ 10% des séjours hospitaliers).
Les hospitalisations en cours (actives)
- Les hospitalisations en cours correspondent au nombre de personnes actuellement à l’hôpital.
- Elles sont comptées chaque jour tant que le patient positif au SRAS-CoV-2 est hospitalisé, incluant le jour de l’admission ou du test positif (date la plus tardive entre les deux) ainsi que le jour du congé.
- En cas de transfert hospitalier, les patients transférés ne sont comptés qu’une seule fois.
Les hospitalisations incidentes (nouvelles)
- Elles sont présentées selon la date la plus tardive entre le test positif et la date d’admission.
- Les patients transférés d’un centre hospitalier à un autre ne sont comptés qu’une seule fois dans les nouvelles hospitalisations.
Hospitalisations de patients ayant reçu un diagnostic de COVID-19 à l’urgence
Cette mesure présente les nouvelles consultations à l’urgence pour un diagnostic de COVID-19 se terminant par une hospitalisation. Les hospitalisations sont présentées selon la date de départ de l’urgence, qui équivaut à la date d’admission chez les patients hospitalisés.
Le nombre d’admissions attribuables à la COVID-19 est sous-estimé, notamment en raison des patients admis sans passer par l’urgence, des patients quittant l’urgence avant que le diagnostic de COVID-19 ait été confirmé ou des pratiques de saisie locales.
À propos des graphiques
- Les hospitalisations sont ventilées selon la région sociosanitaire de résidence du patient et non selon la région où l’hôpital est localisé.
- Le nombre d’hospitalisations actives et incidentes peut être moins élevé pour les journées les plus récentes en raison d’un retard dans la saisie de l’information. Les journées les plus affectées par ce retard sont présentées dans une zone grisée.
- Le nombre d’hospitalisations incidentes est révisé hebdomadairement et de façon rétroactive. Il est donc normal que des valeurs passées changent au fil du temps lorsque, par exemple, une donnée est ajustée ou saisie en retard.
- Les graphiques des taux d’hospitalisations incidentes par âge et sexe n’incluent pas les hospitalisations d’âge ou de sexe inconnu. Les totaux par âge ou sexe pourraient ainsi différer des données officielles qui incluent ces données manquantes.
Pourcentage de positivité
Les TAAN sont utilisés à des fins diagnostiques chez certaines clientèles prioritaires présentant des symptômes compatibles avec la COVID-19. Ces clientèles incluent notamment les personnes à risque élevé de complications (ex. les personnes hospitalisées ou dans des milieux d’hébergement), les travailleurs du réseau de la santé en contact avec des usagers, ainsi que les personnes pour lesquelles un traitement contre la COVID-19 pourrait être envisagé (par exemple PaxlovidMC). Une liste plus détaillée est disponible ici.
- Un test positif correspond à une personne ayant obtenu un résultat de test de laboratoire positif. Les tests de laboratoire positifs dans les 89 jours suivants sont exclus, mais les réinfections survenues 90 jours ou plus après un épisode de COVID-19 sont incluses. Une personne peut donc être représentée plus d’une fois.
- Un test négatif correspond à une personne ayant obtenu un résultat de laboratoire négatif. Chaque résultat de test de dépistage qui s’avère négatif est comptabilisé, à l’exception des tests négatifs obtenus pendant un épisode infectieux de 90 jours. Une personne peut être représentée plus d’une fois.
- Le nombre de tests admissibles correspond au nombre total de tests de dépistage réalisés, à l’exception de ceux réalisés du jour 2 au jour 89 d’un épisode infectieux de COVID-19. Ils incluent les épisodes de réinfections 90 jours ou plus après le début de l'épisode précédent. Un seul test par personne peut être comptabilisé par date de prélèvement. Ce nombre est égal à la somme des test positifs et négatifs.
- Le pourcentage de positivité (%) correspond à la proportion d’épisodes distincts de COVID-19 parmi les tests admissibles chez des personnes susceptibles à l’infection (c.-à-d., excluant les résultats émis dans les 90 jours suivant un premier épisode). Le pourcentage de positivité inclut les réinfections après 90 jours. Le pourcentage de positivité se calcule en divisant le nombre de tests positifs par le nombre total de tests admissibles réalisés.
À propos du graphique présentant des pourcentages de positivité
- Les données présentées dans ce graphique sont révisées hebdomadairement et de façon rétroactive.
- Le pourcentage de positivité inclut les tests négatifs sur des prélèvements effectués à des dates différentes et les tests positifs plus de 90 jours après un épisode infectieux de COVID-19 (réinfections). Pour les personnes ayant eu plus d’un prélèvement pour une même journée, un seul résultat est conservé.
- Par exemple, si une personne teste négatif le 1er janvier, positif le 3 janvier, négatif le 10 janvier et négatif encore le 2 juin de la même année :
- Le 1er janvier, elle sera incluse dans les tests négatifs.
- Le 2 janvier, elle ne sera comptabilisée nulle part pour cette journée.
- Le 3 janvier, elle sera incluse dans les tests positifs.
- Le 10 janvier, son résultat négatif sera exclu des tests négatifs car la date du test négatif est incluse dans l’épisode infectieux de 90 jours.
- Le 2 juin, son résultat négatif sera inclus dans les tests négatifs puisque le 90 jours infectieux est passé.
Semaines épidémiologiques (CDC)
- Le regroupement des données par semaine est du dimanche au samedi afin de correspondre aux semaines CDC.
- La date affichée pour la présentation par semaine est le dimanche, soit la date de début de la semaine CDC.
- Les semaines CDC sont utilisées dans plusieurs études épidémiologiques, notamment celles des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ainsi que pour la vigie des virus respiratoires par l’Agence de la santé publique du Canada (ASPC)pour assurer la comparabilité des semaines entre les années.
- Elles débutent un dimanche et la semaine CDC 1 d’une année est la première semaine de 4 jours ou plus. Cette dernière peut donc inclure quelques jours de l’année civile précédente. À l’inverse, les premiers jours d’une année civile peuvent être compris dans la dernière semaine CDC de l’année précédente.
- Comme les semaines CDC peuvent chevaucher deux mois, elles ne permettent pas de recréer parfaitement des mois ou des années civiles.
Sources des données
Les données sur la COVID-19 sont diffusées à 11 h chaque mercredi. Elles sont issues de différentes sources et l’heure de leur extraction diffère selon la source.
Indicateur | Source | Heure et date d’extraction | Donnée la plus récente diffusée |
---|---|---|---|
Décès |
| 17 h, la veille du jour de diffusion | La veille |
Hospitalisations actives et incidentes de patients ayant un test positif au SRAS-CoV-2 |
| 11 h, la veille du jour de diffusion |
|
Hospitalisations incidentes de patients ayant reçu un diagnostic de COVID-19 à l’urgence |
| 7 h, la veille du jour de diffusion | L’avant-veille |
Pourcentage de positivité
|
| 2h30, la veille du jour de diffusion | La veille |
Populations (dénominateurs des taux)
|
| Non applicable | Septembre 2021 |
Vagues et périodes
- Vague 1 : 23 février 2020 - 11 juillet 2020
- Vague 2 : 23 août 2020 - 20 mars 2021
- Vague 3 : 21 mars 2021 – 17 juillet 2021
- Vague 4 : 18 juillet 2021 – 4 décembre 2021
- Vague 5 : 5 décembre 2021 – 12 mars 2022
- Vague 6 : 13 mars 2022 – 28 mai 2022
- Vague 7 : 29 mai 2022 - 3 septembre 2022
- Période de haute endémicité : 4 septembre 2022 – 26 août 2023
- Saison 2023-2024 : 27 août 2023 – 24 août 2024
- Saison 2024-2025 : 25 août 2024 - 23 août 2025
- Saison 2025-2026 : 24 août 2025 - en cours
- Période cumulative : 20 février 2020 – en cours
Vagues :
Au cours de la pandémie de COVID-19, 7 vagues distinctes ont été identifiées pour faciliter la communication et les analyses épidémiologiques. Les critères utilisés pour déterminer le début d'une vague comprennent une augmentation significative de l'incidence et du pourcentage de positivité, des répercussions sur divers indicateurs de transmission, une hausse hebdomadaire observée sur plusieurs semaines et des éléments modifiant la dynamique de transmission. La fin d'une vague est généralement la veille du début d'une nouvelle vague.
Haute endémicité :
À la suite de la 7e vague de la pandémie, la situation épidémiologique a connu des changements notables. L'émergence rapide de diverses sous-lignées de variants, une transmission maintenue à un niveau élevé, et des fluctuations de moindre amplitude ont été observées dans des indicateurs tels que le taux de reproduction effectif et le pourcentage de positivité. Cette phase a été désignée comme une "période de haute endémicité". Cette expression visait à décrire une transmission active et soutenue à un niveau relativement élevé dans la population sur une période prolongée.
Saison de virus respiratoires (à partir de 2023-2024) :
Bien que la COVID-19 ne présente pas encore de saisonnalité établie, une présentation des données qui suit le calendrier habituel des saisons des virus respiratoires (semaines CDC 35 à 34) permet l’intégration de la vigie de la COVID-19 avec celle des autres virus respiratoires d’intérêt. Cette stratégie vise principalement à simplifier la présentation, la visualisation et l’interprétation des données, tout en soutenant les mesures d’intervention de santé publique.