Au Québec, des résultats de génotypage LGV indéterminés sont obtenus pour moins de 10% des spécimens rectaux. Ce pourcentage varie selon les trousses utilisées pour le prélèvement. La trousse Aptima (Hologic), utilisée dans certaines régions au Québec est celle pour laquelle les résultats sont le plus souvent indéterminés, dû à la dégradation de l’ADN dans le processus d’extraction requis pour ce milieu de transport.

À partir de juillet 2021, le LSPQ référera au laboratoire national de microbiologie (LNM) de Winnipeg pour détection de LGV, les spécimens Aptima dont le résultat est indéterminé, ce qui peut allonger le temps-réponse habituel. Vous devez vous renseigner auprès de votre organisation afin de vérifier si vous utilisez la trousse Aptima dans votre milieu.

Lors d’un résultat de génotypage LGV indéterminé, il est recommandé de suivre l’indication actuelle du guide de l’INESSS et de l’outil LGV du MSSS, soit de commencer ou de poursuivre le traitement avec la doxycycline 100 mg PO BID pour un total de 21 jours consécutifs lors d’une infection rectale, en présence d'un résultat positif à C. trachomatis avec un génotype indéterminé si la personne a des facteurs de risque pour la LGV.

Pour les cliniciens qui ont utilisé la trousse Aptima : il est recommandé de commencer ou de poursuivre le traitement lors de l’obtention d’un résultat LGV indéterminé et d’aviser la personne de le cesser lors de la réception d’un résultat négatif au génotypage LGV du LNM de Winnipeg émis par le LSPQ, le cas échéant.